esta es una solucion que encontre no es mi aporte pero la pongo por si es de ayuda:

Reinstalando Windows solucionariamos el problema, pero para evitar esto podemos hacer lo siguiente:

1. Arrancamos con el CD de instalacion de Windows XP (yo use uno con SP2 integrado).
2. Pulsamos R para entrar en la consola de recuperacion del sistema.
3. Nos pide que elijamos la instalacion de Windows. Normalmente solo tenemos 1 y pulsando 1 bastara.
4. Luego nos pide la contraseña del Administrador. Lo normal es que pulsando Intro entre si no pusimos ninguna durante la instalacion de WinXp; sino deberiamos saberla.
5. Una vez dentro de la linea de comandos, escribimos "CD .." para ir a C:\. (Detras de CD hay un espacio y luego los 2 puntos).
6. Escribimos FIXMBR. Pulsamos 's' para confirmar.
7. Escribimos FIXBOOT. Pulsamos 's' para confirmar.
8. Reiniciamos y deberia arracar Windows sin problemas. A mi me funcionó.

Suerte. Espero que sea de ayuda.

Los archivos que ponen el sector de arranque del Windows XP son ntldr, boot.ini y ntdetext.com y estan el directorio raiz C:\

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k onda, mira hay algo q tambien t puede servir, puedes bajarte un soft q se llama redo backup lo quemas en un cd o lo metes en una usb para bootear desde ahi, con eso puedes ver todos tus archivos y desde ahi los puedes recuperar, y ya despues tendrias q ver si despues quieres formatear tu maquina, pero t recomiendo ese soft para recuperar datos lo he usado y es bueno.

Espero t ayude la info sino aqui seguimos ayudando entre todos

en primera, no entiendo por k querrias borrar el sector de arranque de linux de tu disco duro, siendo el segundo SO instalado es el que controla el acceso a ambos sistemas....bueno espero k no hayas dañado la tabla de particiones de tu disco duro, por que si lo hiciste no te queda mas remedio que formatearlo.

Otra cosa que puedes hacer es :

1.- reinstalar windows - cuando inicias la instalacion el instalador reconocera la particion k contiene windows y te ofrecera recuperar esa instalacion, la seleccionas y windows se sobre escribira asi mismo, no borrara tus archivos pero todos los programas k hayas instalado no funcionaran.

2.- hacer una instalacion de windows en una particion que tengas libre en el mismo disco duro, esto te instalara el cagador necesario para acceder a los dos sistemas.

3.- usar otra compu y meter el disco duro en cuestion para sacar tu info.

4.- usar un live de linux y acceder a las particiones de windows para sacar la info.

en lo particular te recomiendo la numero 4 si puedes acceder a tus particiones y estan tus datos, ya la hiciste, si no, ya te fregaste.

esa es una opcion bro pero bueno eso me ha pasado varias ocaciones solo por andar jugando con linux jejeje pero aqui te tengo la solucion que yo uso se llama super grub que te recupera el sector de booteo para que inicies con windows o linux checate el link tiene las instrucciones de como hacerlo es un archivo que pesa como 2 mb lo quemas y arrancas con el

http://atibogo.wordpress.com/2007/11/25/super-grub-disk-disco-especializado-en-el-arranque-del-pc/

yo opino que quemes un live cd de windows de los que ahy en la red.....se carga desde el cd y te permite ver particiones...y archivos .....saludos