Pues no mencionas las características de tu PC pero eso general mente pasa cuando el Disco Duro es Sata y el Sistema Operativo que vas a instalar no trae los drivers necesarios para esos Discos, checa el modelo de tu Tarjeta Madre o de Tu PC y descarga desde la pagina del Fabricante los drivers Para Discos Sata y cuando vayas a instalar el sistema ahí un momento al inicio donde dice que si necesitas instalar algún driver extra presiones F6, presiónalo en ese momento y instalas el driver faltante y veras que continuara la instalación y te reconocerá tu Disco Duro y sus particiones.
Ahí algunas computadoras que en el BIOS tiene la opción de configurar como quieres usar el Disco duro, como Sata o que si no cuentas con los drivers puedes utilizarlo como IDE y así ya no necesitaras nada mas, puedes checarle y ver si tiene esa opción tu PC y modificar la configuración si se requiere.
O instala algún sistema que ya traiga esos drivers ya sea modificado por alguna persona que se los allá agregado o que los traiga nativamente como el Windows Vista o Seven.