A mi me gusta Prestashop es muy estable y fácil de utilizar con muy buen diseño yo acabe de montar una tienda propia pueden verla aqui
hasta ahora estoy subiendo los productos pero ahí voy

Hmmm no soy muy conocedor pero existe Joomla, Oscomerce, ambos los puedes descargar e instalar en tu servidor, puedes preguntar con algunos expertos sobre la seguridad de cada uno, me habian comentado que Joomla tiene agunas vulnerabilidades, es cosa de investigar

Con joomla puedes utilizar virtual mat

con Oscomerce, pues esta mas orientado a tiendas virtuales, sigue esperando mas respuestas hasta luego