Tan importante como una instalación correcta es un mantenimiento futuro correcto. Con el uso del PC se crean archivos temporales y se fragmenta el disco ( por poner solo dos ejemplos). Por lo tanto un programa de mantenimiento como el Tune Up, Iolo system mechanic o similar debería estar en la instalación.
En cuanto al resto de programa dependerá del uso que le vayas a dar. Para un uso general
Programas de seguridad: antivirus y firewall o bien suite de seguridad que los incluya
Ofimatica: Office o equivalente, lector de archivos PDF
Graficos: un visor de imágenes como puede ser FastStone Viewer ( muy bueno y gratuito) y un editor ( aquí depende de tus conocimiento)
Video/musica: reproductor de video ( Vlan, gomplayer) y de musica (winamp, jet audio.....)