ya revisaste que los jumpers del los discos duros esten en CABLE SELECT?y si el disco aparece en el administrador de tareas? si es asi probablemente el disco tenga un problema

al parecer la particion de tu disco duro esta dañada, no queda mas que formatear. pero aun puedes recuperar tu informacion, usando Ontrack Easy Recovery

formatea y consigue algun programa para recuperar los archivos no tengas miedo

primero checa fisicamente que este conectado correctamente el cable de datos (ya sea PATA o SATA), checa que el cable de alimentacion de voltaje tambiene este debidamente conectado (no hay pierde porque solo entran de una forma) pero a veces no encajan correctamente por lo que no suministran el voltaje adecuado.
con eso debes de solucionar tu problema.
ahora si haciendo eso.. al encender no funciona verifica manual mente que el disco duro funcione.. com lo haces pones tu manos obre el y podras sentir como funciona. si el disco no reaciona, o sea no gira o no se calienta aunque sea un poquito.. amigo.. tu disco habra pasado a mejor vida. y debera ser reemplado. suerte.

Tambien checa cual tienes puesto como master o cual es esclavo. ya que si ambos son master.. el sistema operativo tiene prioridad para iniciar el sistema y el otro no se vera... ok. saludos.

checate tu administrador de dispositivos que no tenga conflictos ¡